El IESA cuenta con seis centros de investigación y dos centros temáticos, los cuales coordinan la generación de conocimientos y su transferencia en las aulas y demás espacios de debate, a escala local e internacional. Las áreas abarcadas son:

• Liderazgo y Organización
• Emprendedores
• Energía y Ambiente
• Finanzas
• Gerencia Estratégica y Competitividad
• Mercadeo
• Políticas Públicas
• Producción e Innovación Tecnológica

La creación de los centros temáticos se constituyen como multi-productos que integran y coordinan a profesores de distintos centros: el Centro de Emprendedores y el Centro Internacional de Energía y Ambiente. Por otro lado, la Red SEKN (Social Enterprise Knowledge Network) es otra de las iniciativas que genera múltiples productos y que moviliza a profesores e investigadores de distintos centros.